经过数十年的系统研究，科学家现已建构出线粒体核心蛋白组分，并将这些蛋白的功能障碍与超过150种不同疾病联系起来。但是仍有数百种线粒体蛋白的特征缺乏认识或完全未知，同时约有40%的线粒体相关疾病的分子机制未知，严重阻碍这些疾病的诊断和药物开发，使相关病人长期处于无药可用的状态。
为建立一个完整的人源线粒体功能谱，2022年5月25日，华盛顿大学医学院的David J. Pagliarini课题组与Morgridge研究所的Joshua J. Coon课题组合作在Nature杂志发表题为Defining mitochondrial protein functions through deep multiomic profiling的研究文章，利用基于质谱的多组学技术分析超过200株经CRISPR介导的单倍体HAP1细胞敲除株，获得细胞对线粒体扰动的深度分析并提供蛋白功能的机制认知。
另外一篇文章分享：Vögtle, F-Nora, et al. "Landscape of submitochondrial protein distribution." Nature communications 8.1 (2017): 290.
线粒体是具有双层膜结构包裹的细胞器，对细胞的能量代谢起着至关重要的作用。据估计，酵母和人类分别含有线粒体内的蛋白约1000种和1500种，分布在四个不同的子区室中。目前已有许多对线粒体细胞器蛋白组的研究，但是对这些蛋白质在细胞器内的局部定位没有明确解析。
作者结合SILAC标记法与质谱鉴定的手段，研究了线粒体外膜，膜间质，内膜，以及线粒体基质的四个组分的蛋白质组学情况。作者不仅将线粒体各个组分的蛋白组进行更为细化地区分，还发现了新的定位在线粒体中的蛋白，另外，还证明以往一些在线粒体中定位分析有误的蛋白。
作者首次将线粒体蛋白细分成外膜、膜间质、内膜和基质四个不同组分，结合SILAC定量蛋白质组学技术将818种线粒体蛋白质定位在对应的亚区。此外本文不仅对蛋白在线粒体中的亚定位进行重新区分验证，并且发现了206个新的线粒体蛋白，提供其在细胞器内特定定位的详细图谱。
荔园生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合nanoLC-MS/MS纳升色谱，提供亚细胞蛋白质组学分析服务，包括定性和定量分析线粒体蛋白质组、叶绿体蛋白质组等。